本文转自“微生态笔记”,已获授权标题Virustaxonomyintheageofmetagenomics中文标题宏基因组时代的病毒分类期刊NATUREREVIEWS，第一作者
PeterSimmonds
通讯作者RogerHull
作者单位NuffieldDepartmentofMedicine,UniversityofOxford,UK
编译：周煜琦
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摘要
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Abstract
由宏基因组方法确定的病毒种类与数量都远超过传统实验方法能确定的数量。在年波士顿的宏基因组时代病毒分类学术研讨会上，专家们提议：只通过宏基因组确定而未经过表观特征分析的病毒应当正式归入病毒分类委员会（ICTV）的分类系统中。虽然仅依据宏基因组序列进行分类与传统依据表观特征分类相去甚远，但全球病毒组的综合特性分析仍依赖更加完善的病毒序列分类框架。在本文中，作者们思索了将宏基因组数据归入ICTV数据的必要性及方法，同时呈现了被该机构执行委员会认可的观点。
前言
病毒专营寄生生活，存在于几乎所有细胞形式生物中。依据遗传物质差异，大致可分为单链、双链DNA以及RNA病毒，它们的基因组大小差异很大，从2,到2,,bp不等。宏基因组方法极大地增加了我们对病毒多样性的认识，冲击了传统的病毒分类学方法。过去ICTV对于新的病毒的分类与描述往往需要侵染宿主的信息、裂解周期、病毒质粒结构和特征等。通过宏基因组测序分析发现的病毒缺少这类传统分类学所必需的信息，但它们可能在生态系统中占有重要地位，与宿主共存甚至共生。以往对于这一类非人类病原体或是不造成全球性生态失衡的病菌
