新研究病毒和遗传一起影响HIV感染过程

根据PLOSComputationalBiology发表的新研究,病毒和人类遗传学因素占人类免疫缺陷病毒(HIV)的人群中发病率的约三分之一。研究结果表明,患者遗传学通过触发HIV病毒基因组中的突变影响疾病进展。

HIV患者的疾病进展速度不同。在具有较高病毒载量的人中,HIV的发展更快。

以前的研究表明,受感染者的遗传学和他们特定的HIV株的遗传学都影响病毒载量。瑞士洛桑高等理工学院的IstvánBartha和同事是第一位研究人类和病毒遗传学对同一组患者病毒载量的相对影响的科学家。

研究人员从名艾滋病毒患者中收集患者和病毒基因数据。他们使用称为线性混合模型的计算建模方法来确定人类和病毒遗传学如何解释患者之间病毒载量的差异。

他们发现,HIV病毒株之间的遗传差异解释了患者病毒载量差异的29%,而人类遗传变异解释了8.4%。两者解释30%的病毒载量变化,这表明病人遗传学诱导基因突变的艾滋病病毒,因为它在病人体内发挥大部分的影响。

“我们的论文表明,病人和感染病毒的遗传构成有助于艾滋病毒感染的临床过程,”研究总监JacquesFellay说。

需要对更大群体的患者进行进一步研究以确认和改进研究结果。尽管如此,“结合宿主和病原体数据为我们提供了对HIV控制的遗传决定因素的新见解,”Fellay说:“类似的策略可用于更好地了解其他慢性传染病。”

原始出处:

IstvánBartha,PaulJ.McLaren,ChansonBrummeetal.EstimatingtheRespectiveContributionsofHumanandViralGeneticVariationtoHIVControl.PLoSComputationalBiology,Published:February9,,doi:10./journal.pcbi..

Abstract:

WeevaluatedthefractionofvariationinHIV-1setpointviralloadattributabletoviralorhumangeneticfactorsbyusingjointhost/pathogengeneticdatafromHIVinfectedindividuals.Weshowthatviralgeneticdiversityexplains29%ofthevariationinviralloadwhilehostfactorsexplain8.4%.Usingajointmodelincludingbothhostandviraleffects,weestimateatotalof30%heritability,indicatingthatmostofthehosteffectsarereflectedinviralsequencevariation.

本期编辑:蒲公英本文来源:生物

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