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年以来，新冠疫情可能是最最热门的话题。作为一名生信学习者或者工作者，你何曾或多或少想借助自己的力量，通过自己的生信技巧，生物学知识，来研究一下新冠病毒的起源等相关的研究。接下来几期推文将会陆续和大家分享一些关于新冠病毒的最基础的基因分析。该系列推文打算主要写给面向生信初学者，所以请各位大佬不喜勿喷。
背景介绍事件发生冠状病毒病疫情，是由严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2型（SARS-CoV-2），能够人传人，进而所引发的全球大流行疫情。疫情在年尾发现于中国湖北武汉，随后在年初迅速扩散至全球多国，逐渐变成一场全球性大瘟疫，是全球自第二次世界大战以来面临的最严峻危机。截至年4月15日，全球已有多个国家和地区累计报告超过万名确诊病例，导致超过11万名患者死亡。
目前公认的数据统计认为，首宗感染个案发病时间是年12月1日。医院就诊的患者可能出现于12月12日。12月26日，武汉市呼吸与重症医学科医生张继先最早发现和上报此不明原因肺炎，并怀疑该病属传染病。其后该病在武汉市出现大规模疫情。另外1月13日起，疫情陆续蔓延到泰国、日本及韩国等国家，1月21日波及美国西雅图，为亚洲以外的首例确诊个案。在1月30日中国境外证实有3个国家出现社区传播，世界卫生组织于当日宣布疫情为“国际公共卫生紧急事件”。2月底意大利、韩国与伊朗三国的确诊人数急速增加，29日，世卫组织将疫情的全球风险级别提升为“非常高”。3月11日，世卫组织宣布此次疫情已构成“全球大流行”，世卫组织并于3月13日表示欧洲已经成为当前大流行瘟疫的中心。
新冠病毒起源新型冠状病毒（COVID-19）的是一种新病毒，属于冠状病毒家族，该家族还包括严重急性呼吸综合征（SARS）冠状病毒和引起某些类型普通感冒的病毒。新型冠状病毒nCoV-的自然宿主很可能是蝙蝠，但目前中间宿主还没有定论。近期一些研究指出，穿山甲，水貂还有蛇都可能是中间宿主。
新冠病毒结构核酸序列分析证明COVID-19由新型冠状病毒(novelcoronavirus，-nCoV)引起。-nCoV为正链单链RNA病毒，基因组长约30kb，两端为非编码区，中间为非结构蛋白编码区和结构蛋白编码区。非结构蛋白编码区主要包括开放读码框架1a和ORF1b基因，编码16个非结构蛋白，即NSP1～16。结构蛋白编码区主要编码刺突蛋白、包膜蛋白、膜蛋白和核衣壳蛋白。它进入细胞的受体与非典病毒SARS-CoV一样，均为ACE2。
可用的数据NCBINCBI专门为新型冠状病毒的序列创建了一个主页：
