病毒株(strain)：同一种病毒的不同分离株或不同来源的病毒系
病毒型别(type)：同种病毒的不同血清型别
病毒野生型(Wildtype):从自然宿主中新分离出的,或者是实验室采用的
病毒突变体(mutant)：与野生病毒株的不同表型的变异株,已清楚其机理
病毒变异体(variant)：与野生病毒株的不同表型的变异株,并不清楚其机理
病毒准株(quasispecies):在一个宿主体内，子代病毒出现了与原始感染株不一致，该变异个体称为病毒准株。
病毒物质变异的类型
1.病毒基因组碱基序列变异引起的表型改变
2.病毒基因组之间相互作用导致的重组与重配
3.病毒基因组与宿主细胞基因组的整合导致的遗传变异
突变分子改变的类型
错配
缺失、插入和移框突变
重排
病毒突变类型
Synonymousmutation同义突变（由于生物的遗传密码子存在兼并现象，在某一碱基改变后，在原来的某种aa的位置译成同一种aa，此现象称同义突变。）
Missensemutation错义突变----渗漏突变型、中性突变（由于bp的替换，使一种aa的密码子变为另一种aa的密码子，在合成多肽时，译成了不同的aa，从而引起基因突变。这种突变被称为错义突变。）
Nonsensemutation（无义突变：是编码某一氨基酸地三联体密码经碱基替换后,变成不编码任何氨基酸地终止密码UAA、UAG或UGA。虽然无义突变并不引起氨基酸编码的错误,但由于终止密码出现在一条ｍＲＮＡ的中间部位，就使翻译时多肽链的终止就此终止，形成一条不完整的多肽链。）
Silentmutation沉默突变：中性突变，同义突变（另一类DNA的碱基改变虽然导致氨基酸变化，但不影响相应蛋白质的活性（突变的是无关紧要的位置），称为中性替代（neutralsubstitution））
Forwardmutation正突变（正向突变由野生型变为突变型的基因突变。）
Reversemutation突变体(mutant)经过第二次突变又完全地或部分地恢复为原来的基因型和表现型
Suppressormutation抑制突变：原有突变存在，但表型效应被二次突变阻抑。反密码子也跟着突变
渗漏突变型：错义突变的产物有部分活性（半显性，不规则显性）
组成型突变constitutivemutation与酶的合成有关的调节基因的一种突变。即原来酶的合成量受调节基因调节的诱导酶或阻遏酶，由于调节基因发生变异，酶的合成变为组成型（不管生长条件如何，酶的合成量总是恒定的）的一种现象。在诱导酶或阻遏酶的情况下，由特异的调节基因决定其结构的阻遏物通过与操纵基因结合，就会使该操纵基因控制下的某结构基因群（操纵子）的转录受到抑制。产生这种阻遏物的基因如果发生变异，它所成的阻遏物变得没有活性，不能和操纵基因结合，或由于操纵基因发生变异，成为不能与阻遏物结合的状况，这时操纵子的转录就不再受到抑制，操纵子所决定的蛋白质就会以组成型的方式被合成出来。为了将由于操纵基因变异所产生的组成型与因阻遏物发生变化所产生的组成型相区别，特将前者称为操纵基因组成型突变。
无效突变体nullmutant：病毒的一个基因完全失活(由于大片段插入、缺失或重排而导致基因产物完全无效)。用于确定病毒的必需基因。
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