病毒“种”是指构成一个复制谱系(replicatinglineage)、占据一个特定小生境(ecologicalniche)、具有多个分类特征的病毒。
病毒属是一群具有某些共同特征的种。其属名的词尾“virus”,但在设立一个新的病毒属时必需有一个同时被承认的代表种(typespecies)。
病毒科是一群具有某些共同特征的属，科名的词尾为“viridae”。
病毒目：是目前最高的分类阶元。病毒目是一群具有某些共同特征的科,目名的词尾为“virales”。
病毒分类原理及其依据
原理：强调其分类和命名的稳定性、实用性、认可性和灵活性。
稳定性是指病毒名称及其隶属关系一旦确定下来，就应该尽可能的保留。实用性是指病毒分类体制应该对病毒学研究领域是有用的。认可性是指病毒分类阶元和名称应该为病毒学研究者乐意接受和使用，所以，认可性也是实用性的必然结果。灵活性是指病毒分类阶元可以依据某些新发现而进行重新修订和再确定。
依据：主要以病毒粒子特性、抗原性质和病毒生物学特性等作为依据。
病毒粒子特性：①病毒形态：如大小、形状、包膜和包膜突起的有无，衣壳结构及其对称性②病毒生理生化和物理性质：如分子量，沉降系数，浮力密度，病毒粒子在不同pH、温度、Mg2+、Mn2+、变性剂、辐射中的稳定性
③病毒基因组：如基因组大小、核酸类型、单双链、线状或环状，正负链，G+C所占的比例、核苷酸序列等
④病毒蛋白：如结构蛋白和非结构蛋白的数量，大小以及功能和活性，氨基酸序列等；⑤病毒脂类含量和特性；⑥碳水化合物含量和特性；⑦病毒基因组组成和复制：基因组结构、复制策略、开放阅读框数量和位置、转录转译特性、转译后加工、病毒蛋白聚集和病毒组装的位置，病毒成熟与释放的部位和特性
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